Offer 1 of 48
Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association

Experimental Ultrahigh Field

The Experimental Ultrahigh Field Magnetic Resonance group at the Max Delbrück Center works on magnetic resonance imaging and magnetic resonance spectroscopy in preclinical, translational, and population-based research projects.

Our group operates magnetic resonance infrastructure up to 9.4 Tesla, including cryogenically cooled radiofrequency coils for high-sensitivity imaging and spectroscopy. This infrastructure is used for structural and functional magnetic resonance imaging, diffusion-weighted imaging, quantitative imaging, magnetic resonance spectroscopy, and the development of new imaging and post-processing approaches.

In addition to magnetic resonance methodology, we work with large imaging datasets from population cohorts. A particular focus is the NAKO Health Study, one of the largest population-based health studies in Germany. The Max Delbrück Center is one of the five magnetic resonance imaging sites of NAKO and contributes to the acquisition of standardized magnetic resonance imaging data for this cohort.

Our research therefore combines magnetic resonance imaging, neuroimaging, biomedical image analysis, and computational methods. In the context of neuroinflammatory diseases such as multiple sclerosis, we are interested in identifying structural brain changes and lesion patterns in large magnetic resonance imaging datasets.

Projects in the group range from magnetic resonance method development and image acquisition to data processing, image analysis, machine learning, and translational biomedical applications. The advertised project is particularly suited for students interested in computer vision, deep learning, medical image analysis, and large-scale neuroimaging data.

Typical candidate profiles include:

– Backgrounds in computer science, computational sciences, computer vision, remote sensing, data science, biomedical engineering, medical image analysis, physics, or related fields
– Interest or experience in image processing, segmentation, deep learning, or quantitative image analysis
– Programming experience, preferably in Python and familiarity with tools such as PyTorch, nnU-Net, or similar software is an advantage
– Interest in magnetic resonance imaging, neuroimaging, population cohorts, and translational biomedical research

Masterarbeit: KI-basierte Erkennung von Läsionen der Multiplen Sklerose in großen MRT-Populationskohorten

Evaluation bestehender und neuer nnU-Net-basierter Deep-Learning-Modelle zur automatisierten Erkennung und Segmentierung von Läsionen der Multiplen Sklerose in großen populationsbasierten Gehirn-MRT-Datensätzen.

Aufgabenbeschreibung

Evaluation bestehender nnU-Net-Modelle zur Segmentierung von MS-Läsionen
Anpassung und ggf. Training neuer nnU-Net-Modelle für populationsbasierte MRT-Daten
Analyse von FLAIR- und T1-gewichteten Gehirn-MRT-Daten
Qualitätskontrolle automatischer Läsionssegmentierungen
Vergleich automatisierter Segmentierungsergebnisse mit verfügbaren radiologischen Informationen oder Expert*innenbewertungen
Entwicklung reproduzierbarer Workflows für die Verarbeitung großer MRT-Datensätze
Unterstützung bei der Identifikation möglicher RIS-/MS-Kandidat*innen in Populationskohorten

Erwartete Qualifikationen

Wir suchen eine motivierte Person im Masterstudium mit Interesse an computergestützter medizinischer Bildanalyse. Idealerweise bringen Sie mit:

  • Studium der Informatik, Computer Vision, Remote Sensing, Data Science, Biomedical Engineering, medizinischen Bildverarbeitung oder eines verwandten Fachs
  • guten Programmierkenntnissen, vorzugsweise in Python
  • Interesse an Deep Learning, neuronalen Netzen und medizinischer Bildanalyse
  • idealerweise Erfahrung mit PyTorch, nnU-Net, oder ähnlichen Tools
  • Interesse an MRT, Neuroimaging, Multiple Sklerose und translationaler biomedizinischer Forschung
  • sorgfältiger, strukturierter und selbstständiger Arbeitsweise
  • guten Englischkenntnissen

Unser Angebot

Wir bieten ein spannendes interdisziplinäres Projekt an der Schnittstelle von MRT-Bildgebung, Neuroimmunologie, Populationsmedizin und künstlicher Intelligenz. Die Arbeit bietet die Möglichkeit, mit großen realen MRT-Datensätzen zu arbeiten und zu einem klinisch relevanten Forschungsprojekt zur Früherkennung von Multipler Sklerose beizutragen.

Die Arbeit kann als Masterarbeit oder studentisches Forschungsprojekt durchgeführt werden. Bei erfolgreichem Verlauf besteht die Möglichkeit, Ergebnisse in wissenschaftliche Publikationen einzubringen.

Hinweise zur Bewerbung

Bitte senden Sie eine E-Mail an sonia.waiczies@mdc-berlin.de

Fakten

Anzahl Angestellte 30
Kategorie Abschlussarbeit
Standort Deutschland, Berlin, Berlin-Buch
Aufgabengebiet Soziales, Bildung & Gesundheit, Gesundheitswesen, Medizintechnik
Beginn frühestens frühestmöglich
Umfang Vollzeit
Vergütung nein
Remote / Homeoffice teilweise möglich
Arbeitssprache & erwartetes Niveau
  • Englisch ( sehr gute Kenntnisse )
Homepage https://www.mdc-berlin.de/person/dr-sonia-waiczies
Social Media Links

Anforderungen

Studiengang Ingenieurwissenschaften, Medizin & Gesundheit, Medizin
Computerkenntnisse ja

Kontakt

Kontakt-Person PD Dr. Sonia Waiczies
Kontakt-E-Mail sonia.waiczies@mdc-berlin.de

Bewerben

Bewerbungsfrist 31.07.2026
Bewerbungsunterlagen
per Email
per E-Mail sonia.waiczies@mdc-berlin.de